Causa
Você projeta com conectores e administra conectores fêmeas e machos separadamente. Agora, as duas definições de funções de duas definições de conectores que correspondem entre si, que têm o mesmo TAG, não combinam mais. A formação de par entre o lado fêmea e o lado macho do conector, portanto, não existe.
Solução
Verifique, na definição do conector para o lado fêmea e para o lado macho, se está configurada a definição de função correta. Para isto abra a caixa de diálogo Propriedades <...>, e observe na guia Definição do conector as configurações no campo Definição de função.
Para a definição do conector do lado fêmea, a definição da função deve ficar na "Definição do conector para fêmeas". Para a definição do conector do lado macho, a definição da função deve ficar na "Definição do conector para machos".
Altere as configurações divergentes conforme estas indicações, e em seguida execute uma nova verificação.